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有没有更好的方法去更换vmd转化后data文件的原子、键、二面角类型?

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发布时间: 2023-2-9 17:12

正文摘要:

各位老师好。我通过packmol构建了含有30个碳酸丙烯酯分子(结构式如图)的box,经过vmd把得到的pdb文件转化为data文件(要在lammps运行)。但是经过vmd的topo转化后的data文件有一个很大的问题就是,其定义的原子类 ...

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