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高斯基态优化,优化过后的分子结构过于平面

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发布时间: 2023-2-9 19:19

正文摘要:

本帖最后由 南京吴彦祖 于 2023-2-10 11:10 编辑 我优化了两个分子,都是使用的B3PLYP/6-31G(d). 分子1和分子2 分子2优化之后三氟甲基是垂直平面往内的,没出现虚频等情况 但是分子1优化之后出现了甲基虚 ...

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南京吴彦祖 发表于 Post on 2023-2-10 11:13:39
sobereva 发表于 2023-2-10 04:12
没有叫B3PLYP的泛函

求助时候别写“后天导师就要找我了”,这关别人什么事

好的,谢谢,我先学习一下
南京吴彦祖 发表于 Post on 2023-2-10 11:12:30
KSeGaSn 发表于 2023-2-9 22:04
庚嗪为什么不能是平面结构啊… 有报道单晶是碗状或者扭曲的吗?没有的话平面也很符合预期。另外阅读http:// ...

好的 谢谢
南京吴彦祖 发表于 Post on 2023-2-10 11:11:52
mfdsrax2 发表于 2023-2-9 20:15
为什么平面结构就不对?是文献里类似结构做出来的都不是平面吗?

我当时也是这么想的,因为看了少了四个甲基的分子优化的时候,不是平面的就觉得是不是哪里有点问题,因为我刚接触计算还不太懂,我在文献中看到的应该是作者计算的T1的优化,T1的优化不是平面的
sobereva 发表于 Post on 2023-2-10 04:12:00
没有叫B3PLYP的泛函

求助时候别写“后天导师就要找我了”,这关别人什么事

头脑里要有构象的概念,上面那个基团旋转过程中可能不止一个极小点,此时优化出来的结构取决于初猜结构。
如果不懂构象搜索,看下文
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
KSeGaSn 发表于 Post on 2023-2-9 22:04:46
本帖最后由 KSeGaSn 于 2023-2-9 22:08 编辑

庚嗪为什么不能是平面结构啊… 有报道单晶是碗状或者扭曲的吗?没有的话平面也很符合预期。另外阅读http://sobereva.com/557,B3LYP过度估计共轭体系的平面性是有可能的(我用PBE0优化其他的也出现过这样的问题)。试试用wB97xD优化看看吧。
mfdsrax2 发表于 Post on 2023-2-9 20:15:46
为什么平面结构就不对?是文献里类似结构做出来的都不是平面吗?

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