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关于AdNDP分析的求助

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发布时间: 2023-2-14 15:33

正文摘要:

想求助同一多中心键怎么展示在同一个图上呢,即比如说二中心键有18个,怎么将18个二中心键都在一个图上展示出来(我附上几张文献上的图展示一下我的意思),这是有什么软件还是multiwfn能直接展示出来的呢,手册上内 ...

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XiaoZeng 发表于 Post on 2023-2-27 09:37:34
sobereva 发表于 2023-2-27 04:00


在脚本里依次载入各个cub文件,然后都显示成等值面

好的,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2023-2-27 04:00:55
XiaoZeng 发表于 2023-2-26 13:47
老师您的意思是要画AdNDPorb0001.cub的话要输入的路径应该是D:\\study\\Multiwfn\\AdNDPorb0001.cub吗,要 ...



在脚本里依次载入各个cub文件,然后都显示成等值面

仔细看下文提供的脚本内容理解机制
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138
XiaoZeng 发表于 Post on 2023-2-26 13:47:47
sobereva 发表于 2023-2-26 03:13
D:\study\Multiwfn是目录名,又不是cub文件名,VMD能当成文件载入就怪了。根据脚本内容和提示理解,不可 ...

老师您的意思是要画AdNDPorb0001.cub的话要输入的路径应该是D:\\study\\Multiwfn\\AdNDPorb0001.cub吗,要将很多轨道做到一张图上是要将cub的路径都加进去吗
sobereva 发表于 Post on 2023-2-26 03:13:51
XiaoZeng 发表于 2023-2-25 14:03
老师,我操作过程中一直显示读取不了文件,我把轨道的cube文件放在vmd和multiwfn同一个路径下都不能,现 ...

D:\study\Multiwfn是目录名,又不是cub文件名,VMD能当成文件载入就怪了。根据脚本内容和提示理解,不可能解决不了
XiaoZeng 发表于 Post on 2023-2-25 14:03:19
sobereva 发表于 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

老师,我操作过程中一直显示读取不了文件,我把轨道的cube文件放在vmd和multiwfn同一个路径下都不能,现在转不过来弯来,能麻烦您指点我一下吗
这是导入VMD窗口的指令:
color Display Background white
display depthcue off
display rendermode GLSL
for {set i $istart} {$i<=$iend} {incr i 1} {
set idx [format %04d $i]
set name " D:\\study\\Multiwfn"
puts Loading\ $name
mol new $name type {cube}
mol modstyle 0 $idinit Isosurface $isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 0 $idinit ColorID $posclr
mol modmaterial 0 $idinit Transparent
mol addrep $idinit
mol modstyle 1 $idinit Isosurface -$isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 1 $idinit ColorID $negclr
mol modmaterial 1 $idinit Transparent
incr idinit 1

这是VMD中的报错:
Loading  D:\study\Multiwfn
ERROR) Could not read file  D:\study\Multiwfn
Unable to load file ' D:\study\Multiwfn' using file type 'cube'.
XiaoZeng 发表于 Post on 2023-2-17 11:29:05
sobereva 发表于 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

好的,谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2023-2-15 05:59:03
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

说得非常清楚了

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