关于gmx hbond氢键计算的问题

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发布时间: 2023-2-21 11:00

请问下各位老师，我用gmx hbond计算氢键，使用-ac，输出了这个xvg文件，想问下红色下划线的这四个参数都是什么意思？谢谢

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lrl 发表于 Post on 2023-2-23 20:03:52

楼主好，我想请教一下你算氢键用的命令脚本，能不能教教我，小白想学

xuxu 发表于 Post on 2023-2-22 10:26:42

好的，sob老师，我想再请教下，计算氢键的自相关函数值是负的，是不是有问题？以及用自相关函数表示氢键的寿命能用于蛋白---蛋白之间吗？因为我看了好多文献都是用在蛋白和水之间的

sobereva 发表于 Post on 2023-2-22 04:18:33

在grace里对xvg绘图，看图例内容便知

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