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求助：动力学模拟能量极小化步骤出现如图所示报错，请问该如何解决？

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马天湉

发布时间: 2023-2-21 12:59

正文摘要:

报错内容：There are inconsistent shifts over periodic boundaries in a molecule type consisting of 25 atoms. The longest distance involved in such interactions is 5.407 nm which is above h ...

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jiangyan 发表于 Post on 2024-6-6 16:55:13

本帖最后由 jiangyan 于 2024-6-6 16:56 编辑

马天湉发表于 2023-2-22 14:17
谢谢老师

请问一下，你得问题处理完了嘛，我也遇到了一样的问题不知道怎么解决，想知道你是怎么解决这个问题的呀

马天湉 发表于 Post on 2023-2-22 14:17:50

sobereva 发表于 2023-2-22 04:19
跟盒子太大毫无关系
暗示模拟可能跑崩了，照着检查
http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2023-2-22 04:19:50

跟盒子太大毫无关系
暗示模拟可能跑崩了，照着检查
http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

elvisng 发表于 Post on 2023-2-21 20:52:01

你是不是有分子在盒子的邊緣出了盒子的範圍?

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