计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

MOLPRO CASSCF(7,5)/cc-pvdz优化结构计算太慢

查看数: 1358 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 1
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-2-21 17:48

正文摘要:

MOLPRO的CASSCF(7,5)/cc-pvdz方法优化一个结构大概十个重原子,用了15核,每核1G内存,为什么每次七八个小时才算这么一点

回复 Reply

baobao123 发表于 Post on 2023-2-21 19:58:52
zjxitcc 发表于 2023-2-21 19:24
你现在估计是以15*12核在跑(MPI和OpenMP混合并行),互相挤占资源,肯定非常慢。如果机器物理核心数只有15 ...

老师我的机器一共32核,现在是180核心在跑吗,我试下您说的方法
zjxitcc 发表于 Post on 2023-2-21 19:24:56
你现在估计是以15*12核在跑(MPI和OpenMP混合并行),互相挤占资源,肯定非常慢。如果机器物理核心数只有15,那要用molpro -n 15 -t 1 -m ...只使用MPI并行,不使用OpenMP并行。
zjxitcc 发表于 Post on 2023-2-21 18:33:11
展示一下你提交molpro完整命令行参数;展示
echo $OMP_NUM_THREADS
echo $MKL_NUM_THREADS
运行结果。
综合上述结果,运行top,看看是不是开启了MPI和OpenMP混合并行,并超过了机器物理核数导致变慢。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 03:42 , Processed in 0.186468 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list