sobereva 发表于 2023-2-24 06:37 明白了,再次感谢社长。 |
heyman1022 发表于 2023-2-23 10:37 不等效 Multiwfn算自由体积用的是范德华球叠加的范德华表面确定哪些是占据哪些是非占据区域。connolly surface相当设一个原子球在这种范德华表面滚动时球的中心的轨迹对应的表面,显然球的半径为0时,connolly surface就和前面那种范德华表面是等价的。 |
sobereva 发表于 2023-2-23 04:48 非常感谢社长的回复。 我仔细去看了《谈谈分子体积的计算》http://sobereva.com/102,并重新计算了一下。当我将MS 的connolly radius调整为0.001时,所得自由体积与multiwfn计算结果接近,那我是否可以理解为在参数设置方面connolly radius与multiwfn的默认电子密度等效? |
不同程序对表面的定义不同,正如分子体积有不同定义(《谈谈分子体积的计算》http://sobereva.com/102) Multiwfn里的定义在博文里已经体现得很清楚了,而且还可以直接可视化观看便于理解定义方式 M$用的具体定义看help,特别是搞清楚Connolly surface的定义,并且理解Connolly radius的含义 |
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