求助，做蛋白质-配体复合物的限制性动力学时出现报错，称找不到配体的位置限制wen'...

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发布时间: 2023-2-23 14:46

各位老师，我在做蛋白质-配体的相互作用，其中在限制性动力学过程中出现报错（如图），我的配体的.itp和.top文件是在sobtop中生成的，其中配体的.itp文件中的[atomtypes]部分挪到了ffnonbonded.itp中，且"#ifdef P ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-2-24 05:59:18

itp文件没找到，显然检查路径问题
如果那个itp没放在当前目录下，就放到当前目录下，或者include时候用绝对路径。如果本来就用不着位置限制，不include也可以

qingqingdong 发表于 Post on 2023-2-23 18:39:30

confidence 发表于 2023-2-23 15:51
你topol文件中itp的顺序与molecules中物质的顺序保持一致试试看？

仍然报错

confidence 发表于 Post on 2023-2-23 15:51:25

你topol文件中itp的顺序与molecules中物质的顺序保持一致试试看？

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