Gromacs模拟三元复合物体系做SMD出现报错后中断的问题

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发布时间: 2023-2-24 12:53

各位老师好，学生正在对protac与蛋白形成的三元复合物进行SMD模拟，由于第一次做这方面模拟，所以参考的是此教程并结合论坛的帖子进行学习（http://www.mdtutorials.com/gmx/umbrella/05_pull.html）蛋白质是amber ...

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李西华 发表于 Post on 2023-3-1 14:23:44

Lacrimosa 发表于 2023-2-28 10:11
拉伸距离超过了盒子的一半，可以尝试加大盒子在拉伸方向上的尺寸

谢谢老师，学生试试

Lacrimosa 发表于 Post on 2023-2-28 10:11:07

拉伸距离超过了盒子的一半，可以尝试加大盒子在拉伸方向上的尺寸

李西华 发表于 Post on 2023-2-26 20:59:01

有老师可以看看吗

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