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能否在找过渡态过程中,固定物质某些原子之间的键的类型?

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发布时间: 2023-2-27 19:14

正文摘要:

各位老师好!如图1所示,想找这个反应的过渡态。让O2夺取羟基上的H,生成·OOH自由基和另外一个自由基A,但是每次H离开O原子,物质A上的C和O之间就会形成双键,如图2所示,导致在找过渡态过程中能量一直震荡不收敛, ...

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HJLCZ 发表于 Post on 2023-2-28 19:06:34
fatpig 发表于 2023-2-28 18:21
1. 就是建议至少把基组加大到6-31g(d,p),多加的p是给H的,或者至少指定给那个要反应的H。
可以看http:/ ...

明白了,谢谢你
fatpig 发表于 Post on 2023-2-28 18:21:07
HJLCZ 发表于 2023-2-27 20:04
谢谢你的解答,对于您的回答有如下疑问:
1.因为刚接触计算不久,不太明白你说的第1点是什么意思,能麻 ...

1. 就是建议至少把基组加大到6-31g(d,p),多加的p是给H的,或者至少指定给那个要反应的H。
可以看http://sobereva.com/336

2. 如果你第一点的初始猜测就错了,你算后面的有啥用...所以建议先做stable=opt;接着做freq,可以在gaussview里看到你第一点的振动方向,而你用calcfc是没法直接看到的。
HJLCZ 发表于 Post on 2023-2-27 21:31:29
chands 发表于 2023-2-27 21:18
建议还是先查相关资料。注意到你是做气相反应,(气态)羧酸在空气中相当稳定。另外这个反应就算有,能垒 ...

好的谢谢老师
chands 发表于 Post on 2023-2-27 21:18:37
HJLCZ 发表于 2023-2-27 21:05
老师是这样的,我们专业不是化学专业,这个反应在本专业的一些文献当中有所体现,但是说的很笼统,文献中 ...

建议还是先查相关资料。注意到你是做气相反应,(气态)羧酸在空气中相当稳定。另外这个反应就算有,能垒也会非常高。
HJLCZ 发表于 Post on 2023-2-27 21:05:02
chands 发表于 2023-2-27 20:40
这个反应很奇怪,你确定这个反应会发生吗?你确定机理是这样吗?另外,Ph-CH2-COO·容易脱羧,生成Ph-CH2· ...

老师是这样的,我们专业不是化学专业,这个反应在本专业的一些文献当中有所体现,但是说的很笼统,文献中只是给出了反应能垒图,不知道本领域的审稿人有没有验证他这个反应的过渡态的真实性。我的目的是想把这个反应做的详细些,然后像老师后面说的,得到PH-CH2-COO·,分解生成PH-CH2·和CO2。
HJLCZ 发表于 Post on 2023-2-27 20:41:18
wzkchem5 发表于 2023-2-27 20:20
仔细阅读http://sobereva.com/414,了解为什么双键不是导致不收敛的原因

谢谢老师,博文中提到gview中的成键关系不影响量化计算的结果。那想请问一下老师,对于我上述反应,找过渡态一直不收敛的原因,老师能说一下可能是什么原因导致的吗?
chands 发表于 Post on 2023-2-27 20:40:02
这个反应很奇怪,你确定这个反应会发生吗?你确定机理是这样吗?另外,Ph-CH2-COO·容易脱羧,生成Ph-CH2·和CO2。
wzkchem5 发表于 Post on 2023-2-27 20:20:46
仔细阅读http://sobereva.com/414,了解为什么双键不是导致不收敛的原因
HJLCZ 发表于 Post on 2023-2-27 20:04:33
本帖最后由 HJLCZ 于 2023-2-27 20:19 编辑
fatpig 发表于 2023-2-27 19:33
如果是我的话:
1. 既然是H transfer,至少加个p给H吧...
2. 做单点的stable=opt;

谢谢你的解答,对于您的回答有如下疑问:
1.因为刚接触计算不久,不太明白你说的第1点是什么意思,能麻烦您说的稍微详细点吗?
2.你的意思是对于我初始摆的过渡态的结构进行stabl=opt,看看波函数是否稳定,再对该结构进行freq操作,若振动方向与我预期相同,是不是可以直接读取力常数进行opt=ts的操作。想问一下这样操作和我帖子里面那样操作有什么不一样的地方吗?
因为刚接触量化计算,若有些常识性的东西问的不合适,还请多多包涵。
fatpig 发表于 Post on 2023-2-27 19:33:45
如果是我的话:
1. 既然是H transfer,至少加个p给H吧...
2. 做单点的stable=opt;
3. 读上一步的guess,单点做freq,看虚频的振动模式是否符合预期;
4. readfc读上一步的力常数找TS.

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