amber跑有机配位化合物体系MD，出现输出总能为正的问题

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本帖最后由 Kiuzz 于 2023-2-28 17:59 编辑 各位老师好，我算的体系有625个原子，其中有五个二价锌离子和十个抗衡阴离子（其中有一个阴离子在有机体系空腔中），想要通过轨迹得到该化合物的平均能量。配体参数由a ...