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水中多元酸解离的计算级别合适么?

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发布时间: 2023-3-2 11:42

正文摘要:

本帖最后由 社会主义小战士 于 2023-3-2 12:19 编辑 如题。各位大佬,这是我想模拟一种多元羧酸在水中的动力学行为,这是我写的Gaussian 16输入文件,计算的泛函准备选用B3LYP,基组准备用def2TZVP,这样的处理合 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-3-3 05:55:51
社会主义小战士 发表于 2023-3-2 12:31
所以我现在的策略是:
1. 继续使用Gaussian 16,但是降低基组精度;
2. 改用ORCA,去掉SMD Water。

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

下次删帖处理
社会主义小战士 发表于 Post on 2023-3-2 19:14:54
chands 发表于 2023-3-2 17:44
C-PCM溶剂模型,PCM溶剂模型的一种,没有SMD那么好,但能用,你可以查ORCA 手册implicit solvent model一 ...

感谢!
chands 发表于 Post on 2023-3-2 17:44:04

C-PCM溶剂模型,PCM溶剂模型的一种,没有SMD那么好,但能用,你可以查ORCA 手册implicit solvent model一节。
社会主义小战士 发表于 Post on 2023-3-2 16:36:28

这是啥?
chands 发表于 Post on 2023-3-2 14:27:43
社会主义小战士 发表于 2023-3-2 14:25
谢谢大佬!
但是我在指定SMD跑ORCA的时候,提示Hessian不支持SMD?

那就用CPCM吧
  1. ! CPCM(solvent)
复制代码


社会主义小战士 发表于 Post on 2023-3-2 14:25:28
chands 发表于 2023-3-2 13:37
基组用6-311+G**就可以了(甚至可以用6-31+G**预优化),用Gaussian可以加一行%mem 指定内存,看你应该用 ...

谢谢大佬!
但是我在指定SMD跑ORCA的时候,提示Hessian不支持SMD?
chands 发表于 Post on 2023-3-2 13:37:29
社会主义小战士 发表于 2023-3-2 12:31
所以我现在的策略是:
1. 继续使用Gaussian 16,但是降低基组精度;
2. 改用ORCA,去掉SMD Water。

基组用6-311+G**就可以了(甚至可以用6-31+G**预优化),用Gaussian可以加一行%mem 指定内存,看你应该用集群算的,否则无法指定36核。

ORCA可以设置SMD,如下:
  1. %cpcm smd true
  2.             SMDsolvent "water"
  3. end
复制代码
先优化一下,反正你这个结构柔性很大,到时跑MD还有一堆构象呢。

社会主义小战士 发表于 Post on 2023-3-2 12:31:40
社会主义小战士 发表于 2023-3-2 12:28
发现这样的计算级别在Gaussian里提示内存不够!!!
于是转而用ORCA跑,但是ORCA又提示SMD模型搞不了FREQ ...

所以我现在的策略是:
1. 继续使用Gaussian 16,但是降低基组精度;
2. 改用ORCA,去掉SMD Water。
各位前辈大佬们,这样两种方案哪种更合适?
本来的计算目的是为了后续跑MD的。
社会主义小战士 发表于 Post on 2023-3-2 12:28:49
本帖最后由 社会主义小战士 于 2023-3-2 12:32 编辑

发现这样的计算级别在Gaussian里提示内存不够!!!
于是转而用ORCA跑(B97-3c),但是ORCA又提示SMD模型搞不了FREQ,心态要崩了

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