求助乙醇盒子边界分子拉长的问题

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发布时间: 2023-3-11 20:47

新手尝试做一个乙醇盒子的能量最小化。将trr文件载入VMD看轨迹，发现从第二帧开始出现边界分子跨越拉成直线的问题（如下图）。猜测和周期边界条件有关，但是不知道该如何设置，或者是坐标文件出了问题吗？以下附上 ...

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MGET127 发表于 Post on 2023-3-11 21:25:05

sobereva 发表于 2023-3-11 21:07
老生常谈的问题。看我的GROMACS培训班的ppt

好的老师，我以后会注意标题的格式，十分感谢。

sobereva 发表于 Post on 2023-3-11 21:07:32

老生常谈的问题。看我的GROMACS培训班的ppt

sobereva 发表于 Post on 2023-3-11 21:04:26

不要自己在标题里手写[新手求助]这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了，以后注意

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