wzkchem5 发表于 2023-3-13 20:02
检查一下电荷和自旋多重度是否设置正确，可能是因为设置不合理导致氨基变成了自由基阳离子

明白了，再次感谢老师！

Conan 发表于 2023-3-13 11:58
就是提问中我新补的那第三张图，如果这样没问题的话那应该就是我的优化问题了，总之非常感谢老师！

检查一下电荷和自旋多重度是否设置正确，可能是因为设置不合理导致氨基变成了自由基阳离子

wzkchem5 发表于 2023-3-13 18:19
“过于相似”为什么是个问题？可能本来就应该相似。
位置离谱具体是怎么个离谱法？

就是提问中我新补的那第三张图，如果这样没问题的话那应该就是我的优化问题了，总之非常感谢老师！

Conan 发表于 2023-3-13 11:08
非常感谢老师回答！对于第二个收敛问题我会重新尝试，对于成键问题我明白不需要管键连问题，但是：1.可能 ...

“过于相似”为什么是个问题？可能本来就应该相似。
位置离谱具体是怎么个离谱法？

wzkchem5 发表于 2023-3-13 17:46
仔细阅读http://sobereva.com/414，了解为什么不需要管键怎么连的问题。
另外切忌以哪个计算收敛了为判断 ...

已在提问中补充了不收敛的中间结构截图

wzkchem5 发表于 2023-3-13 17:46
仔细阅读http://sobereva.com/414，了解为什么不需要管键怎么连的问题。
另外切忌以哪个计算收敛了为判断 ...

非常感谢老师回答！对于第二个收敛问题我会重新尝试，对于成键问题我明白不需要管键连问题，但是：1.可能对我的初猜结构位置有些影响，因为我曾经试着对V4O124-与(RNH3)+进行一个初猜位置优化，虽然没有收敛，但进入.log文件观察中间结构发现几个分子之间的位置越来越离谱，不明白是不是分子间发生了氢键作用；2.研究过的另一个体系是伯胺RNH2与金属酸H4V4O12之间的氢键作用，在建模上与现在这个体系过于相似，所以一直困惑。所以恳请老师指导解决办法。

仔细阅读http://sobereva.com/414，了解为什么不需要管键怎么连的问题。
另外切忌以哪个计算收敛了为判断哪个结构合理的标准。一定要从化学角度判断这个氢是否存在，例如通过画共振式或者查文献类似体系的方式。有的时候不合理的结构反倒容易收敛，合理的结构反倒不好收敛。