求助关于晶体掺杂及切面问题

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 19:14:07

本帖最后由 BBH 于 2023-3-20 16:37 编辑

各位大佬好，想问一下，当我要对某个晶体进行掺杂和切割晶面，再计算吸附能时，以下步骤是否正确：
1：对晶胞进行几何优化
2：make P1、切面、添加真空层、掺杂、固定表面层以下的原子、几何优化
3：添加吸附气体、几何优化

建立模型：
空间群号：206 a=10.117A 切割晶面：（110）掺杂了4个Sn原子在In2O3中（建立的In2O3模型几何优化成功）

掺杂后几何优化出错：

输入文件：

ITO_90_10_model (1 1 0)输入.txt (1.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)
输出文件：

ITO_90_10_model (1 1 0)输出.txt (33.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

吸附前：

吸附后：

老师，就是在添加吸附气体后，最上面一排原子中，少了一个，少的那一个与最下面的一排中的掺杂原子是对称的

含光君 · 发表于 Post on 2023-3-13 20:31:45

正确

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 20:40:23

含光君发表于 2023-3-13 20:31
正确

好的，谢谢老师

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 22:47:50

含光君发表于 2023-3-13 20:31
正确

老师，我掺杂优化的过程中出错了，我已补充材料，能否麻烦您帮我看一眼，如何处理该问题

含光君 · 发表于 Post on 2023-3-13 23:08:33

你这电脑内存多大，交了几个核算？

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 23:14:06

含光君发表于 2023-3-13 23:08
你这电脑内存多大，交了几个核算？

交了32个核算，这个电脑内存是指哪个呀，怎么看呀，不太会

含光君 · 发表于 Post on 2023-3-13 23:27:45

BBH 发表于 2023-3-13 23:14
交了32个核算，这个电脑内存是指哪个呀，怎么看呀，不太会

含光君 · 发表于 Post on 2023-3-13 23:41:09

BBH 发表于 2023-3-13 23:34
老师，单层回复里面我不太会这个图片发送，我把照片补充到一楼里面去了

你直接说8G不就好了，你在这台电脑上用32核8G内存算？如果是那就内存太小了，可以看一下算的时候是不是内存100%占满了

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 23:42:26

含光君发表于 2023-3-13 23:41
你直接说8G不就好了，你在这台电脑上用32核8G内存算？如果是那就内存太小了，可以看一下算的时候是不是内 ...

我用的是师兄的超算进行运算的

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 23:46:45

含光君发表于 2023-3-13 23:41
你直接说8G不就好了，你在这台电脑上用32核8G内存算？如果是那就内存太小了，可以看一下算的时候是不是内 ...

2605899677

BBH · 发表于 Post on 2023-3-13 23:47:08

本帖最后由 BBH 于 2023-3-13 23:50 编辑

含光君发表于 2023-3-13 23:41
你直接说8G不就好了，你在这台电脑上用32核8G内存算？如果是那就内存太小了，可以看一下算的时候是不是内 ...

Baekshr_19920506，老师可以看一下一楼的最底下吗，我一小时内回复已达上限

含光君 · 发表于 Post on 2023-3-14 00:43:25

BBH 发表于 2023-3-13 23:47
Baekshr_19920506，老师可以看一下一楼的最底下吗，我一小时内回复已达上限

谢谢你的信任，不过一来我最近比较忙、同时水平也有限，应该只能偶尔在公社上回答一些问题。
上面你提到是用师兄的超算算的，那么最简单直接的方法就是问你师兄，因为他肯定比我和大家更了解你算的体系。此外建议你先自学一些计算相关内容，对其涉及到的东西有个初步了解，这样提问也会更有针对性，也更有助于问题解决。

BBH · 发表于 Post on 2023-3-14 07:53:38

含光君发表于 2023-3-14 00:43
谢谢你的信任，不过一来我最近比较忙、同时水平也有限，应该只能偶尔在公社上回答一些问题。
上面你提到 ...

好的，谢谢老师，师兄和我算的不是一个体系，只是师兄有时候也用MS进行计算，我有问过，他说他也没算过气体吸附这类型，所以可能也不懂，老师就是我这个是用超算算的，那上面就是出错的那个问题，还想问一下如何处理。

BBH · 发表于 Post on 2023-3-16 22:52:40

含光君发表于 2023-3-14 00:43
谢谢你的信任，不过一来我最近比较忙、同时水平也有限，应该只能偶尔在公社上回答一些问题。
上面你提到 ...

老师，您好，我又来求助啦，想问一下，就是我掺杂和几何优化完模型后，添加吸附气体在构建的体结构中会有两个原子消失（这两个原子在构建的模型内分别与另外两个原子是一样的），这种情况正常吗

含光君 · 发表于 Post on 2023-3-16 22:56:11

BBH 发表于 2023-3-16 22:52
老师，您好，我又来求助啦，想问一下，就是我掺杂和几何优化完模型后，添加吸附气体在构建的体结构中会有 ...

我没太明白你说的意思，要不你上一下图？回帖就行别在原帖改了

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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助关于晶体掺杂及切面问题

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