“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助关于晶体掺杂及切面问题

查看数: 3690 | 评论数: 17 | 收藏 Add to favorites 2
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
BBH
发布时间: 2023-3-13 19:14

正文摘要:

本帖最后由 BBH 于 2023-3-20 16:37 编辑 各位大佬好,想问一下,当我要对某个晶体进行掺杂和切割晶面,再计算吸附能时,以下步骤是否正确: 1:对晶胞进行几何优化 2:make P1、切面、添加真空层、掺杂、固定 ...

回复 Reply

BBH 发表于 Post on 2023-3-21 22:42:03
含光君 发表于 2023-3-20 17:04
左下角property窗口切到symmetry system看化学组成,那里面化学组成没变就行。
出现这种情况可能是显示 ...

好的,谢谢老师
含光君 发表于 Post on 2023-3-20 17:04:01
BBH 发表于 2023-3-20 16:37
老师,不好意思,最近在忙别的事情,就没有登录这个,现在才看见您的消息,我已经将图片上传了,还麻烦您 ...

左下角property窗口切到symmetry system看化学组成,那里面化学组成没变就行。
出现这种情况可能是显示问题,应该在display style里把显示模式改成original
含光君 发表于 Post on 2023-3-16 22:56:11
BBH 发表于 2023-3-16 22:52
老师,您好,我又来求助啦,想问一下,就是我掺杂和几何优化完模型后,添加吸附气体在构建的体结构中会有 ...

我没太明白你说的意思,要不你上一下图?回帖就行别在原帖改了
BBH 发表于 Post on 2023-3-16 22:52:40
含光君 发表于 2023-3-14 00:43
谢谢你的信任,不过一来我最近比较忙、同时水平也有限,应该只能偶尔在公社上回答一些问题。
上面你提到 ...

老师,您好,我又来求助啦,想问一下,就是我掺杂和几何优化完模型后,添加吸附气体在构建的体结构中会有两个原子消失(这两个原子在构建的模型内分别与另外两个原子是一样的),这种情况正常吗
BBH 发表于 Post on 2023-3-14 07:53:38
含光君 发表于 2023-3-14 00:43
谢谢你的信任,不过一来我最近比较忙、同时水平也有限,应该只能偶尔在公社上回答一些问题。
上面你提到 ...

好的,谢谢老师,师兄和我算的不是一个体系,只是师兄有时候也用MS进行计算,我有问过,他说他也没算过气体吸附这类型,所以可能也不懂,老师就是我这个是用超算算的,那上面就是出错的那个问题,还想问一下如何处理。
含光君 发表于 Post on 2023-3-14 00:43:25
BBH 发表于 2023-3-13 23:47
Baekshr_19920506,老师可以看一下一楼的最底下吗,我一小时内回复已达上限

谢谢你的信任,不过一来我最近比较忙、同时水平也有限,应该只能偶尔在公社上回答一些问题。
上面你提到是用师兄的超算算的,那么最简单直接的方法就是问你师兄,因为他肯定比我和大家更了解你算的体系 。此外建议你先自学一些计算相关内容,对其涉及到的东西有个初步了解,这样提问也会更有针对性,也更有助于问题解决。
BBH 发表于 Post on 2023-3-13 23:47:08
本帖最后由 BBH 于 2023-3-13 23:50 编辑
含光君 发表于 2023-3-13 23:41
你直接说8G不就好了,你在这台电脑上用32核8G内存算?如果是那就内存太小了,可以看一下算的时候是不是内 ...

Baekshr_19920506,老师可以看一下一楼的最底下吗,我一小时内回复已达上限
BBH 发表于 Post on 2023-3-13 23:46:45
含光君 发表于 2023-3-13 23:41
你直接说8G不就好了,你在这台电脑上用32核8G内存算?如果是那就内存太小了,可以看一下算的时候是不是内 ...

2605899677
BBH 发表于 Post on 2023-3-13 23:42:26
含光君 发表于 2023-3-13 23:41
你直接说8G不就好了,你在这台电脑上用32核8G内存算?如果是那就内存太小了,可以看一下算的时候是不是内 ...

我用的是师兄的超算进行运算的
含光君 发表于 Post on 2023-3-13 23:41:09
BBH 发表于 2023-3-13 23:34
老师,单层回复里面我不太会这个图片发送,我把照片补充到一楼里面去了

你直接说8G不就好了,你在这台电脑上用32核8G内存算?如果是那就内存太小了,可以看一下算的时候是不是内存100%占满了
含光君 发表于 Post on 2023-3-13 23:27:45
BBH 发表于 2023-3-13 23:14
交了32个核算,这个电脑内存是指哪个呀,怎么看呀,不太会


BBH 发表于 Post on 2023-3-13 23:14:06
含光君 发表于 2023-3-13 23:08
你这电脑内存多大,交了几个核算?

交了32个核算,这个电脑内存是指哪个呀,怎么看呀,不太会
含光君 发表于 Post on 2023-3-13 23:08:33
你这电脑内存多大,交了几个核算?
BBH 发表于 Post on 2023-3-13 22:47:50

老师,我掺杂优化的过程中出错了,我已补充材料,能否麻烦您帮我看一眼,如何处理该问题

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-22 21:11 , Processed in 4.608137 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list