求助，模拟结果出错，找不到哪里出了问题，求大佬指点！

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发布时间: 2023-3-20 09:49

我用gromacs做水穿过多层COF膜的nvt模拟过程，膜在盒子中间、上下分别是填充的水和真空，在盒子两端加了石墨烯板来施加压力。但是在我nvt跑了5ns之后跑完的结果是下层依旧有很大的真空区，具体跑前跑后的图如下：[ur ...

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zyp1999 发表于 Post on 2023-3-22 15:14:27

sobereva 发表于 2023-3-20 15:03
明显还没压到底，压的程度连真空区都还没消掉，更别提穿膜了

老师，我的mdp文件有没有哪里有问题啊？

sobereva 发表于 Post on 2023-3-20 15:03:08

zyp1999 发表于 2023-3-20 11:15
我还施压了，水不应该会穿过膜到下面的真空区吗？

明显还没压到底，压的程度连真空区都还没消掉，更别提穿膜了

zyp1999 发表于 Post on 2023-3-20 11:15:17

牧生发表于 2023-3-20 10:59
你建立盒子的时候就有真空，然后nvt跑出来真空，很正常啊。。。没有真空才有问题

我还施压了，水不应该会穿过膜到下面的真空区吗？

牧生 发表于 Post on 2023-3-20 10:59:23

你建立盒子的时候就有真空，然后nvt跑出来真空，很正常啊。。。没有真空才有问题

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