sobereva 发表于 2024-6-18 00:21 谢谢卢老师！ |
不会扣篮的后卫 发表于 2024-6-17 05:52 跟VMD没关系 把轨迹拆成单帧结构文件，然后用下文的做法批量调用Multiwfn计算逐帧计算球形度。计算时在主功能12里不用实际电子密度定义等值面，用promolecular电子密度等值面来定义表面就够了（此时输入的文件只要有结构信息即可，不需要有波函数信息）。 详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法 http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html） |
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本帖最后由 不会扣篮的后卫 于 2024-6-17 05:54 编辑 卢老师，您好。我想计算轨迹文件里每一帧的球型度，请问VMD或者其他软件可以给轨迹文件的每一帧加入0.001 a.u.电子密度等值面吗？ |
sobereva 发表于 2024-2-11 20:06 谢谢卢老师！ |
不会扣篮的后卫 发表于 2024-2-11 12:50 Multiwfn图形界面顶端，可以设置显示风格为透明 下文也说了 使用Multiwfn观看分子轨道 http://sobereva.com/269（http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html） |
您好，卢老师。请问您这个帖子中，是调整什么参数来设置出结构外面浅绿色半透明的效果？（我拿C60的molden文件得到了亮绿色不透明的风格）
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