求助：利用Amber和orca进行QM/MM模拟

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发布时间: 2023-3-28 15:35

各位老师，我利用Amber和orca对蛋白质配体复合物进行QM/MM模拟，在开始的最小化出现了问题，没有报错，只是过了一天，它一步都没有动，我不知道是为啥，所以想问问看各位老师，有没有可能是我哪步做错了，图是我的输 ...

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阿志 发表于 Post on 2023-3-29 09:29:58

casea 发表于 2023-3-29 08:23
1. qmmm区域选择的原子过多，你这应该是选择了1-251位残基，肯定算起来特别慢（如果计算资源充足，当我没说 ...

谢谢您的回复，主要是有点太慢了，所以怕自己弄错了。我去把参数改了

casea 发表于 Post on 2023-3-29 08:23:49

1. qmmm区域选择的原子过多，你这应该是选择了1-251位残基，肯定算起来特别慢（如果计算资源充足，当我没说）。
2. 应该是num_threads把

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