计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

用Multiwfn做IRI-π minima的时候,值应该读哪个?

查看数: 1119 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 1
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-3-30 15:04

正文摘要:

本帖最后由 小靖靖 于 2023-3-30 15:25 编辑 跟着IRI_tutorial教程,根据doi.org/10.1002/cmtd.202100007,做IRI-π分析,想还原一下,但是有一个数不太知道读的是哪个?例如下图1,图a、b中的IRI-π=1/1.7,我理 ...

回复 Reply

小靖靖 发表于 Post on 2023-4-12 09:22:41
sobereva 发表于 2023-4-11 23:32
导出成pdb文件,在VMD里看。graphics - representation里用选择语句(serial)可以只显示特定的一个或多 ...

好的,谢谢老师,我在研究一下,老师辛苦啦
sobereva 发表于 Post on 2023-4-11 23:32:51
小靖靖 发表于 2023-4-11 21:21
sob老师,您好,再打扰您一下,向您请教两个问题,第一就是我在定位最小值的点的时候,一共有291个点,当 ...

导出成pdb文件,在VMD里看。graphics - representation里用选择语句(serial)可以只显示特定的一个或多个点,看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html
小靖靖 发表于 Post on 2023-4-11 21:21:40
sobereva 发表于 2023-4-1 11:45
IRI教程里说了(Note: If you hope to reproduce Fig. 11 in IRI original paper, you should select “high ...

sob老师,您好,再打扰您一下,向您请教两个问题,第一就是我在定位最小值的点的时候,一共有291个点,当我要找我想要的点的时候,很难找,点太多堆叠在一起,序号很难看清,有没有更好的方法读自己想要的点呀?第二就是,我现在会将所有的点都显现在图中,也会定位某一个点在图中展现,假如我想在一个图中同时显现4个点,这个可不可以实现呢?如果可以,应该怎么做呀?谢谢老师
小靖靖 发表于 Post on 2023-4-1 14:40:47
sobereva 发表于 2023-4-1 11:45
IRI教程里说了(Note: If you hope to reproduce Fig. 11 in IRI original paper, you should select “high ...

非常感谢sob老师,我再用high quality grid试一下,辛苦老师啦
sobereva 发表于 Post on 2023-4-1 11:45:34
IRI教程里说了(Note: If you hope to reproduce Fig. 11 in IRI original paper, you should select “high quality grid” here)。用high quality grid的时候,你的第三张图的黄色部分的数值是0.14732487,和我的IRI原文里的图上标的相同。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 15:09 , Processed in 0.224019 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list