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Gaussian优化罗丹明B离子化合物后体系中阴阳离子连起来了,这正确吗?

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发布时间: 2023-4-3 17:09

正文摘要:

如我在优化罗丹明B(下图)时,优化结束后氯离子和氮离子自动用单键连接起来了,这种情况对不对?

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adreamy 发表于 Post on 2023-4-5 20:16:22
sobereva 发表于 2023-4-4 06:50
提问时能上传输入文件的时候尽量上传,否则有硬伤别人也不知道,诸如没考虑溶剂模型、初始构型不合理等

...

谢谢sob老师提醒,问题已经解决了。
sobereva 发表于 Post on 2023-4-4 06:50:34
提问时能上传输入文件的时候尽量上传,否则有硬伤别人也不知道,诸如没考虑溶剂模型、初始构型不合理等

另外看此文
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
adreamy 发表于 Post on 2023-4-3 17:39:47
牧生 发表于 2023-4-3 17:37
优化离子结构就行,不需要那个CL,然后把总电荷设为1就行

此外,羧基的氧原子太靠近那个碳,有可能导致 ...

好的,谢谢老师
牧生 发表于 Post on 2023-4-3 17:37:24
优化离子结构就行,不需要那个CL,然后把总电荷设为1就行

此外,羧基的氧原子太靠近那个碳,有可能导致优化后的结果不可靠。因为这个结构应该不会是一个平面结构,所以最上面的环状可能与下面的平面结构呈一定夹角。所以,解决方法,把那个羧基拖成直的结构,使氧原子朝上,各个原子距离既不太远,又不太近,优化后,结构就应该合理了。

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