求助：amber的nc轨迹文件、prmtop、inpcrd文件怎么转化成gromacs的xtc、top、gro文

查看数: 850 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2023-4-3 21:40

你好! 我想用amber的GAMD方法模拟一个膜蛋白和小分子的体系，本人完全是初学者，对amber软件还不太熟悉。所以想用amber跑模拟，之后用gromacs的模块分析。请问有什么方法可以将的amber模拟生成的nc轨迹文件转 ...

回复 Reply

灵芝5 发表于 Post on 2023-4-4 09:39:40

好，多谢卢老师答复！

sobereva 发表于 Post on 2023-4-4 06:16:43

凡是手册里没有明确说在哪里获取的工具，都去Amber安装目录下自己搜

另外ParmED、acpype也可以转格式

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register