求助使用gmx gyrate的时候，受到了周期性的干扰，如何解决？

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发布时间: 2023-4-4 20:07

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sobereva 发表于 Post on 2023-4-5 07:27:16

一个办法是trjconv结合-trans对轨迹进行平移，让那几个地方始终在盒子里面
另一个办法是trjconv结合-pbc cluster处理轨迹周期性，自己弄个索引组把红球都作为一个组，使得模拟轨迹里那个组始终保持完整不被盒子截断

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