求助，计算分子间的相互作用能前的轨迹提取问题

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发布时间: 2023-4-4 20:28

本帖最后由 tym1999 于 2023-4-4 20:27 编辑动力学模拟了辛醇，B(OH)3和水的混合体系，准备用rerun模拟计算B(OH)3和辛醇分子间的相互作用能。首先使用 gmx trjconv提取B(OH)3和辛醇的轨迹，输入命令gmx_mpi tr ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-4-5 07:13:45

根本没必要提取单独部分的轨迹
直接mdp里设能量组，对原有整体的轨迹rerun就完了

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