求助纳米金颗粒加入冰水混合物进行能量最小化后跑散的问题

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发布时间: 2023-4-11 00:22

想观察冰水混合物加入纳米金颗粒后结冰的变化情况，目前已经实现纯水的结冰，利用packmol加入Au13团簇，但是在能量最小化之后，产生的em.gro文件发现Au13团簇已经跑散，查看之前相关的帖子，了解到团簇模型不需要键 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-4-11 12:14:50

具体文件我没时间看，你先看看真空下团簇结构能否维持。
实在不行就把团簇用sobtop产生拓扑文件，自动猜力场参数，使得团簇能维持刚性，然后把合适的LJ参数替换进去

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