AmberTools16 并行测试中某测试样例卡住

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发布时间: 2016-6-30 13:24

仿照 http://sobereva.com/263 安装AmberTools 16，编译了openmpi并行版本，进行并行版本测试（make test，10核）时，在如下图的这个测试中有约20分钟没有结束，CPU也没有在运行任务，后续测试不能进行。终止 ...

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qczgzly 发表于 Post on 2016-11-6 10:48:50

本帖最后由 qczgzly 于 2016-11-7 13:09 编辑

sobereva 发表于 2016-11-5 22:31
正常编译了就会出现相应可执行文件

哦。谢谢Sob师兄~

今天按照手册上的说明重新操作了一遍，问题解决啦。

sobereva 发表于 Post on 2016-11-5 22:31:29

qczgzly 发表于 2016-11-5 21:19
我测试AmberTools16时也出现了相同的问题，觉得应该是找不到antechamber、parmchk2等用来生成小分子力场 ...

正常编译了就会出现相应可执行文件

qczgzly 发表于 Post on 2016-11-5 21:19:54

sobereva 发表于 2016-7-1 00:46
应该正常，就甭管那个测试了

我测试AmberTools16时也出现了相同的问题，觉得应该是找不到antechamber、parmchk2等用来生成小分子力场参数的程序。安装包是从论坛里下的。不知有什么解决办法没？我安装AmberTools就是为了用这个antechamber。。

sobereva 发表于 Post on 2016-7-1 00:46:04

应该正常，就甭管那个测试了

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liyuanhe211	+ 2	了解了，谢谢！

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