genmer产生空心团簇初始构型单体分子取向的设置

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发布时间: 2023-4-20 00:21

有个小问题请教下卢老师，利用genmer产生空心团簇初始构型时，如何控制单体分子取向？如图1是单体分子以及它的偶极矩方向，如果想要生成一个包含若干个该单体分子球壳层结构，且分子偶极矩的方向指向径向向外（如图2 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-4-20 05:09:53

molclus没这个设置，但可以用packmol，要求分子的某个原子出现在指定半径内、某个原子出现在指定半径外，可以对朝向进行控制。但没法精确控制。要精确控制需要自己写针对性的程序实现

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