DNA模拟链子跑出盒子

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发布时间: 2023-4-25 11:21

请问大家这种情况如何处理，我在模拟DNA时加上了这个命令comm-grps = DNAcomm-mode = angular 后期也对轨迹进行了居中和消除平动转动的处理，但是在VMD中看到了DNA双链打开且跑出盒子外。 ...

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Wxy1998 发表于 Post on 2023-4-26 08:40:22

sobereva 发表于 2023-4-26 06:21
这又不碍事
搞清楚什么叫周期边界条件

好的谢谢sob老师

sobereva 发表于 Post on 2023-4-26 06:21:13

这又不碍事
搞清楚什么叫周期边界条件

你若要DNA双链始终在盒子中央，先用trjconv处理轨迹让两条链始终在一起，然后再用trjconv处理一次让DNA的组居中

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