用PES得到过渡态初猜结构使用TS寻找过渡态优化不收敛和振动虚频不在反应方向上

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发布时间: 2023-4-28 17:00

本帖最后由吸血的蚊子于 2023-4-28 17:00 编辑各位老师好，我使用gaussian计算喹啉N夺取乙硒醇的质子的自由能垒，首先需要找到过渡态。寻找过渡态的过程如下：首先分别优化质子转移前后的化合物结构，然后以N, ...

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吸血的蚊子 发表于 Post on 2023-5-9 10:10:35

dnlx 发表于 2023-4-29 11:50
另外，质子转移反应有可能不存在过渡态。
http://bbs.keinsci.com/thread-26076-1-1.html

好的，多谢提醒

吸血的蚊子 发表于 Post on 2023-5-9 09:42:31

wzkchem5 发表于 2023-4-28 19:20
试试优化较低的那个峰对应的结构。你选的那个峰虽然较高，但是可能属于扫描坐标选取不合理导致的假最高点（ ...

谢谢老师，根据您的建议进行了尝试，找到的过渡态优化收敛，且虚频方向在反应坐标上。

dnlx 发表于 Post on 2023-4-29 11:50:27

另外，质子转移反应有可能不存在过渡态。
http://bbs.keinsci.com/thread-26076-1-1.html

wzkchem5 发表于 Post on 2023-4-28 19:20:16

试试优化较低的那个峰对应的结构。你选的那个峰虽然较高，但是可能属于扫描坐标选取不合理导致的假最高点（因为势能曲线看起来在这个点不连续），参见DOI: 10.1002/wcms.34的Figure 3

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