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AOCC编译VASP后运行命令问题

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发布时间: 2023-5-10 17:27

正文摘要:

本帖最后由 chever 于 2023-5-10 17:29 编辑 抄Sob的作业买的7R32工作站参考VASP | AMD和在AMD机器上安装DFT计算软件VASP.6.2.0简明教程 - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (keinsci.com)通过AOCC成 ...

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糖炒DFT 发表于 Post on 2025-1-8 16:37:16
xwaaa 发表于 2024-9-1 11:39
请问怎么绑定插槽?

mpirun  --bind-to socket --map-by socket -np $SLURM_NTASKS  vasp_std
xwaaa 发表于 Post on 2024-9-1 11:39:52
糖炒DFT 发表于 2024-5-22 22:42
可以试试绑定插槽提交,我绑定核心跑就巨慢,换成绑定插槽就比较快,无论MPI还是MPI+openMP;机器 7763  ...

请问怎么绑定插槽?
糖炒DFT 发表于 Post on 2024-5-22 22:42:16
ggshining 发表于 2024-1-23 19:29
我用AOCC+AOCL编的vasp6.3.2,纯MPI的版本始终比MPI+openMP的版本快一点,带openMP的版本只要用多线程速度 ...

可以试试绑定插槽提交,我绑定核心跑就巨慢,换成绑定插槽就比较快,无论MPI还是MPI+openMP;机器 7763 ;  
ggshining 发表于 Post on 2024-1-23 19:29:58
我用AOCC+AOCL编的vasp6.3.2,纯MPI的版本始终比MPI+openMP的版本快一点,带openMP的版本只要用多线程速度就降,用单线程和纯MPI版本差不多,略慢一点点。
也是不知道为什么,CPU是双路AMD9654
nicejunjie 发表于 Post on 2023-7-15 02:10:35
amd的fortran compiler是用的基于open source pgfortran的f18项目。目前不是很建议使用非intel和非pgi/nvidia的fortran 编译器。
chever 发表于 Post on 2023-5-11 19:25:19
hebrewsnabla 发表于 2023-5-11 18:22
双路7R32只有96核,你一楼的写法用了128线程,三楼的写法用了32*48个线程,当然慢了……

是有修改的,4*8, 4*16, 8*4, 8*8, 16*4都有试过
hebrewsnabla 发表于 Post on 2023-5-11 18:22:22
双路7R32只有96核,你一楼的写法用了128线程,三楼的写法用了32*48个线程,当然慢了……
chever 发表于 Post on 2023-5-11 16:20:32
biogon 发表于 2023-5-11 14:16
我看了下那个帖子,用spack编出来的可能就是不太行,不用那个方法编译,改makefile用aocc+aocl编很快可以 ...

十分感谢,迫不及待要试试啦
biogon 发表于 Post on 2023-5-11 14:16:36
本帖最后由 biogon 于 2023-5-11 14:51 编辑
chever 发表于 2023-5-11 12:14
现在用aocc编译出来的就是比mkl的慢,可能没编译好或者运行有问题吧,哈哈

我看了下那个帖子,用spack编出来的可能就是不太行,不用那个方法编译,改makefile用aocc+aocl编很快可以参考我最新发的帖子

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chever 发表于 Post on 2023-5-11 12:14:06
abin 发表于 2023-5-11 10:55
鄙人仅仅在笔记本上测试过,
应该是AMD 6800H, ThinkBook笔记本.
同样是8核心, 计算速度, 和Intel ...

现在用aocc编译出来的就是比mkl的慢,可能没编译好或者运行有问题吧,哈哈

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abin 发表于 Post on 2023-5-11 10:55:01
chever 发表于 2023-5-11 09:30
感谢,我试了一下啦,应该是调用了很多线程,还是很慢



鄙人仅仅在笔记本上测试过,
应该是AMD 6800H, ThinkBook笔记本.
同样是8核心, 计算速度, 和Intel处理器不相上下.

FUcreature 发表于 Post on 2023-5-10 18:19:11
不如返朴归真,直接
  1. mpirun -np 32 $vasp
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