计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

使用OpenBabel基于GaussView保存的pdb文件生成构象生成时,出现信息报错

查看数: 1525 | 评论数: 3 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2023-5-13 11:04

正文摘要:

本人新手,文件是GaussView直接保存的pdb文件,不知道哪里出现了问题

回复 Reply

Tionue 发表于 Post on 2023-5-13 17:30:18
谢谢老师,谢谢老师,我知道了
sobereva 发表于 Post on 2023-5-13 15:54:00
OpenBabel自动用的力场大抵不支持含Si和B的情况,因此没法处理。用gentor产生就完了,参考下文,此体系可旋转的键不算特别多,用gentor是合适的
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
sobereva 发表于 Post on 2023-5-13 15:51:53
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “在进行构象生成时,出现信息报错” 改了,以后务必注意

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 00:14 , Processed in 0.194696 second(s), 31 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list