RF-China 发表于 2023-5-21 11:59 《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272 《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”》http://sobereva.com/413 基组推荐的博文在上面已经回复过了 |
zjxitcc 发表于 2023-5-20 22:13 老师，想做有机分子结构吸附金属离子的结构优化，体系总共约400个原子，200个左右的非氢原子，柔性分子，结构是通过13C NMR和FTIR等构建。目前参考的文献就是利用B3LYP和6-31G基组进行计算，老师您有什么建议呢。 |
|
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-5-20 22:16 编辑 强烈建议弃掉该文献。由于该文献写出了“nuclear magic resonance”、“6-31 base group”等词，说明其计算水平十分可怕，千万不要模仿之。你也千万不要用6-31G去算，仔细阅读《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336 直接说你想做啥计算（例如：单点、结构优化、吸收光谱、荧光光谱、磷光光谱、核磁计算等等），你的体系有多少原子，其中多少非氢原子，是否柔性分子，结构从何而来，大家会给出合理的计算级别。再次强调，不要模仿该文献，不要管他有多少原子。 |
sobereva 发表于 2023-5-20 17:35 嗯，已经进行修改。 |
RF-China 发表于 2023-5-19 10:43 永远说原子数，不要说原子量 基组名写准确 |
本帖最后由 RF-China 于 2023-5-20 22:04 编辑 sobereva 发表于 2023-5-18 15:43 您看我发的那个参考文献，他的原子数就在400个左右，先用Materials studio进行的优化，然后在Gaussian的B3LYP，6-31G基组进行的优化，所以我就想用Gaussian做一下类似的量子化学计算。 |
sobereva 发表于 2023-5-18 15:43 谢谢老师的回复。 |
RF-China 发表于 2023-5-18 15:21 500原子DFT算单点，计算资源好的话愣算能算得动，优化基本没戏（除非用CP2K） Multiwfn不支持M$能导出的任何文件做波函数分析（除非是做那些基于格点数据文件或者几何结构就能做的分析），也永远不会去支持 |
含光君 发表于 2023-5-18 14:08 感谢老师的回复，就是键角变化很大，Gaussian优化结果更加扭曲，紧密。因为这个是之间做的，现在找不到图片了，不好意思。 |
sobereva 发表于 2023-5-18 14:41 感谢老师的回复。500多原子量子化学的计算，除了半经验方法，DFT方法是否可行呢？实际进行计算的时候就先用半经验优化，然后在用优化结果作为初猜，在进行DFT优化（还没实践过这部分内容），这样操作可以吗？“导出的文件”原意是想不用Gaussian，所以不知道MS导出什么文件可用于Ｍｕｌｔｉｗｆｎ的静电势，键级等的分析。 |
|
根本没必要用M$ 500多原子体系用Gaussian做诸如PM6D3这样半经验级别的优化毫无难度 所有的描述都必须非常清楚具体，诸如“导出的文件”导出的是什么文件？“用于Multiwfn分析”分析的到底是什么？不要有任何含糊性和歧义 |
|
问题修改只用改原帖就行了不用接着盖楼。 你说的“将Materials studio优化好的文件导入Gaussian再进行优化的时候，结构变化很大”描述得很含糊，单凭这句话别人也无法理解到底是怎么变的以及变化到底有多大。 |
| 不好意思，是用Gaussian做了优化+频率的计算，然后用Multiwfn进行的ESP分析。 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-2-22 20:53 , Processed in 0.180707 second(s), 25 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites