求助：计算蛋白某部分的RMSD，为什么计算值都是 -nan?

正文摘要:

您好！ 我在计算一个膜蛋白N端25-36残基的RMSD，用的gromacs软件的gmx_mpi rms -s ../all_newbox.pdb -f ../fit3-pro.xtc -o apo10-1-n-rmsd.xvg -n rmsd.ndx -tu ns -dt 1 -e 500指令； 但是计算的值都为-nan, ...