求助 RNA pdb文件在生成拓扑时报错，显示残基未在库里找到，但DNA却可以

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发布时间: 2023-5-20 15:06

求助各位老师，前辈，RNApdb文件在生成拓扑时报错，显示残基未在库里找到，但DNA却可以，想问一下库里有没有RNA残基的定义呢？如果有，我是不是需要把pdb文件残基名修改一下呢？

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sobereva 发表于 Post on 2023-5-21 17:48:35

为什么用那么老版本的CHARMM力场，太过时了

去看力场目录下的r2b文件，弄清楚pdb里的残基名是怎么往rtp里的残基名映射的

sobereva 发表于 Post on 2023-5-20 15:23:23

自觉交代清楚所有相关细节，连用的什么力场都不说

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