msd出图出现波动

查看数: 1501 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2023-5-24 19:37

各位老师，我是统计的两个构型的o原子的msd，我有两个问题 1.msd应该取哪个时段是比较有意义的（比如我总共是是模拟了500ns应该取后100ns还是中间的那？） 2.为什么我的红色msd在最后接近500ns时候出现波动，这是 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2023-5-26 03:41:02

1 取平直的部分拟合，诸如可以用前350000

2 MSD跨度越大时采样越少，统计误差越大，参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班ppt

3 用trjconv结合-skip转换轨迹，使得相邻帧之间的时间间隔更大

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register