IGMH计算弱相互作用氢键的颜色变红

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发布时间: 2023-5-28 00:41

各为大神我在使用IGMH研究分子间的弱相互作用时，如图所示，氧原子与氢原子之间的氢键相互作用出现了红框中的颜色，既有蓝色还有红色，请问是什么原因呢，怎么修改合适呢，请大神们不吝赐教

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sobereva 发表于 Post on 2023-6-3 06:05:34

keyanxiaobai 发表于 2023-6-2 21:31
谢谢老师这个是我用B3YLP/6-31基组优化的然后我在这个优化后的结果后面继续用B3YLP/6-311基组优化的计算 ...

谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题
http://sobereva.com/534（http://bbs.keinsci.com/thread-16396-1-1.html）

好好把理论方法名和基组名写对，这是搞计算化学的人的基本素养

牧生 发表于 Post on 2023-6-2 21:59:18

keyanxiaobai 发表于 2023-6-2 21:31
谢谢老师这个是我用B3YLP/6-31基组优化的然后我在这个优化后的结果后面继续用B3YLP/6-311基组优化的计算 ...

sobereva 发表于 Post on 2023-5-29 09:33:06

nianbin 发表于 2023-5-28 13:45
卢老师那这种氢键是不是强度就比较弱？

C-H...O本来就强不了
另外你这个图显得怪怪的，怀疑计算步骤有问题，诸如没优化，或者计算级别不合适。

nianbin 发表于 Post on 2023-5-28 13:45:55

sobereva 发表于 2023-5-28 02:48
没什么特殊的含义，不要过度解释
纯粹是sign(lambda2)rho里的lambda2在那个位置恰好为正所致

卢老师那这种氢键是不是强度就比较弱？

sobereva 发表于 Post on 2023-5-28 02:48:55

没什么特殊的含义，不要过度解释
纯粹是sign(lambda2)rho里的lambda2在那个位置恰好为正所致

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