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求助sobtop导入chg文件和mol2文件输出itp文件不出现原子电荷值

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发布时间: 2023-5-28 17:23

正文摘要:

用sobtop制作itp力场文件时候chg电荷怎么都导入不进去,输出的itp文件里电荷都是0,但是chg文件里电荷那列也归零了。 我的附件上传不上去,麻烦各位老师看图了

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Nianis 发表于 Post on 2023-5-29 12:07:15
sobereva 发表于 2023-5-29 09:49
我用你的mol2和chg文件通过sobtop产生拓扑文件没发现有任何问题,sobtop的输出信息都在此文件里

好的好的,感谢社长,那应该是我自己的操作系统之类的问题了,我换个电脑试一下。
sobereva 发表于 Post on 2023-5-29 09:49:12
Nianis 发表于 2023-5-28 17:27
昨天做的rs构型还可以导入,不知道为什么其他构型都不行,另外补充一下,我的mol2文件是orca量化计算出来然 ...

我用你的mol2和chg文件通过sobtop产生拓扑文件没发现有任何问题,sobtop的输出信息都在此文件里
output.txt (10.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)


原子电荷在产生的拓扑文件里很正常


Nianis 发表于 Post on 2023-5-28 17:27:52
昨天做的rs构型还可以导入,不知道为什么其他构型都不行,另外补充一下,我的mol2文件是orca量化计算出来然后用ofakeg转成gaussview可读的out再转换出来的,可能是这个原因?

PMD_SS.mol2

1.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

PMD_SS.chg

1.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

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