请教：冻结原子后还会产生位移

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发布时间: 2023-5-31 17:35

在做固体表面吸附模拟时，将固体部分冻结后进行NVT模拟，结果看起来固体整体的位置发生了变化，这是为什么呢？感谢解答

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PHOENIXHMX 发表于 Post on 2023-6-2 08:24:54

sobereva 发表于 2023-6-2 01:17
看不明白你说的是什么情况
如果只是gro里记录的结构有这个问题，轨迹里的帧没问题，就甭管gro里怎么显示 ...

明白了，轨迹里就是正常显示的，谢谢sob老师了

sobereva 发表于 Post on 2023-6-2 01:17:04

PHOENIXHMX 发表于 2023-6-1 16:18
sob老师好，我看了一下轨迹，发现在模拟过程中恢复到了最初的位置，所以这是什么原因导致的呢？对计算结 ...

看不明白你说的是什么情况
如果只是gro里记录的结构有这个问题，轨迹里的帧没问题，就甭管gro里怎么显示的

PHOENIXHMX 发表于 Post on 2023-6-1 16:18:38

sobereva 发表于 2023-6-1 04:40
看起来只是周期性记录方式问题，两部分相差正好一个周期。通过观察轨迹弄清楚是怎么回事，把盒子显示出来

sob老师好，我看了一下轨迹，发现在模拟过程中恢复到了最初的位置，所以这是什么原因导致的呢？对计算结果有影响吗？感谢老师的回复

sobereva 发表于 Post on 2023-6-1 04:40:09

看起来只是周期性记录方式问题，两部分相差正好一个周期。通过观察轨迹弄清楚是怎么回事，把盒子显示出来

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