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如何用multiwfn改变图片的坐标

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发布时间: 2016-7-21 11:14

正文摘要:

老师好,我这里有一个multiwfn生成的波函数等值面图,想修改坐标,不知道怎么操作,希望有人指导一下,谢谢

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Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-27 16:25:25
The absolute value of bond order >=  0.050000                                
#    1:    1(Fe)    4(N ) Alpha:   0.138719 Beta:  0.131824 Total:  0.270543
#    2:    1(Fe)    5(C ) Alpha:  -0.026259 Beta: -0.028155 Total: -0.054414
#    3:    1(Fe)    8(C ) Alpha:  -0.026300 Beta: -0.028199 Total: -0.054499
#    4:    1(Fe)    9(N ) Alpha:   0.138766 Beta:  0.131808 Total:  0.270574
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-27 16:22:24
老师,我在做键级分析的时候,因为是开壳层体系,出来的键级数据分成α和β轨道的,还有最后Total, 我就想问一下,分析的时候是用α那组数据呢,还是Total那组数据?
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-26 22:16:16
非常感谢老师回复我问的这么低级的问题,再次感谢!
sobereva 发表于 Post on 2016-7-26 21:42:32
Eliza-NZH 发表于 2016-7-26 15:04
老师,我知道原子间成键态比反键态能量低。结构更稳定,我现在就是想用NBO方法结合Multiwfn分析出原子间是 ...


最土的做法:用Multiwfn算个Mulliken键级,看符号是正负就完了。正是成键,负是反键。先载入.fch文件,然后输入9,再输入4。
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-26 15:04:50
老师,我知道原子间成键态比反键态能量低。结构更稳定,我现在就是想用NBO方法结合Multiwfn分析出原子间是成键态还是反键态, 时间比较紧急,因为要急着写好文章投出去,您能不能简单的和我说一下计算过程,您只需要大体说一下过程就行,不用说太多,因为我现在刚学习这个,您说得多了我会糊涂的,非常感谢!
sobereva 发表于 Post on 2016-7-22 23:59:45
Eliza-NZH 发表于 2016-7-22 14:50
我这个是结合实验给一点分子轨道分析,不需要太深刻,就想说一点简单点的,我刚学这个高斯计算,不敢分析太 ...

根本不是这么看的。说法太粗糙的。
你先看结构化学书了解什么是成键和反键轨道,是什么轨道形状。
这和原子之间密度大小都完全八竿子打不着。
原子之间密度大小要考虑所有轨道,而且密度大小跟成键强弱根本没直接关系。
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-22 14:50:06
我这个是结合实验给一点分子轨道分析,不需要太深刻,就想说一点简单点的,我刚学这个高斯计算,不敢分析太深奥的东西,回头审稿人再问我比较难得问题我回答不出就不好了,不是说两原子之间如果电子密度大那就是成键态,反之就是反键态吗?这个图是分子波函数轨道等值线图,我从中可以看出电子分布的大小啊,难道不可以简单判断出成键和反键态吗
sobereva 发表于 Post on 2016-7-22 13:33:53
Eliza-NZH 发表于 2016-7-22 12:40
谁知道上面的轨道等值线图的分析主要抓住哪几点?在写文章,能分析出是成键态还是反键态吗?跪求大神指导

一言难尽
主要看成键区域有没有节面来判断
或者可以用Multiwfn做Mulliken键级分解,看看对指定的两个原子,各个轨道对Mulliken键级是正贡献还是负贡献
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-22 12:40:53
谁知道上面的轨道等值线图的分析主要抓住哪几点?在写文章,能分析出是成键态还是反键态吗?跪求大神指导
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-22 12:24:43
谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2016-7-21 19:25:01
Eliza-NZH 发表于 2016-7-21 15:15
老师,我想让我的图片纵横坐标轴一样长,保存出来的图片就是个正方形,这就是我的目的,因为我有三张图片, ...


你得选择6:Input origin and translation vector (For expert user),自定义平移矢量,使得对三个体系,在两个方向上平移矢量大小相同。或者用5:Define by three points,对三个体系使用相同的三个点来定义作图平面。
要么就导出平面数据,用sigmaplot之类对三个体系作图,然后调节坐标轴使其一致。
Eliza-NZH 发表于 Post on 2016-7-21 15:15:05
老师,我想让我的图片纵横坐标轴一样长,保存出来的图片就是个正方形,这就是我的目的,因为我有三张图片,排版的时候想将三个一行排开,可是有的是长方形,不好看,所以我想三个都是正方形就好了
sobereva 发表于 Post on 2016-7-21 11:53:31
你想怎么改坐标?

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