求助MD模拟报错，报错的.pdb文件打开之后只显示部分原子，像是被截断了一样

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发布时间: 2023-6-8 08:43

老师您好，我在做MD模拟的时候，发现体系在跑了7.8ns之后开始输出了一系列报错文件，报错文件打开之后只显示了部分原子，像是被两边截去了一部分一样，如图所示，这个体系一开始加入各个分子是可以正常跑的，但后来 ...

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HYUAN 发表于 Post on 2023-6-8 13:49:41

sobereva 发表于 2023-6-8 13:27
如果是产生出一大堆备份的pdb文件，就是MD崩了
排除方法http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8里都说了

好的，谢谢sob老师，我去仔细看看

sobereva 发表于 Post on 2023-6-8 13:27:24

如果是产生出一大堆备份的pdb文件，就是MD崩了
排除方法http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8里都说了

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