乐平 发表于 2023-6-13 20:35
提问首先还是应该说清楚你要做的具体是什么，描述得越清楚，对你自己也有好处。说不定你写着写着就发现问题 ...

非常感谢你的解答。氧化铟我就固定了最底部的两层，没有全部固定，主要研究的是催化剂表面的几个C H键的断键成键路径，我把氧化铟全固定试试。

提问首先还是应该说清楚你要做的具体是什么，描述得越清楚，对你自己也有好处。说不定你写着写着就发现问题所在了。

首先，你做过渡态搜索，要明确你的过渡态关键的结构是什么反应对应的过渡态。哪两个或多个原子成键？或者断键？


其次，从你给出的结构来看，是发生在铟的氧化物表面的 C-H 反应。那么，你是否固定了催化剂原子？ 还是计算所有的原子？ 你是不是没有说明？ 你再想想你帖子里第一句话

Dmol3跑TS Search时，一开始速度还行，跑到一半速度就会非常慢，像卡住一样，最后程序没跑成功

是不是和没有固定催化剂（铟的氧化物）有关？再看第一点，你是不是抓住了过渡态的关键？

第三，还是在结构上，你的 CH3 里 C-H 距离是 2.05 ~ 2.09， CH3 和 H 之间的距离 4.61 angstrom，你是希望它们成键？还是老死不相往来？想想 C-H 键的键长大约是多少。

做计算首要的关键是结构，结构有问题，计算参数再怎么调整都不可能得到正确的结果。