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求助:rerun获取能量组信息后温度和压力异常

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发布时间: 2023-6-12 20:35

正文摘要:

在进行相互作用力分析的时候,我是先进行正常md ,然后稍微处理了下轨迹,再使用sob老师培训上教的进行rerun gmx grompp -f md.mdp -c md.gro -p .top -o mdrerun.tpr -n index.ndx gmx mdrun -v -deffnm mdrerun ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-6-13 12:14:00
完全没必要管这个
rerun过程无法产生速度,因此温度毫无意义
rerun目的也不是计算原子受力,依赖于原子受力得到的压力也没意义

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WuQs + 3 谢谢

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