|
这就是俩局部极小值啊,没什么不能用的。 过渡态搜索之类后续构象相关计算的结果有效性是个化学问题,取决于你想研究的是什么反应,这个充其量是个初猜。 |
|
分清楚gjf和gif 老生常谈的问题,做量化计算的人一定要有构象搜索的概念,看 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具 http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html 将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html 使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html 研究中只考虑一个构象的时候,通常用自由能最低那个构象。但也可能需要涉及其它的,诸如发生某种反应的构象可能未必是自由能最低的那个。 还有很多问题的研究需要考虑构象权重平均,下文都涉及到了 使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱 http://sobereva.com/383(http://bbs.keinsci.com/thread-6186-1-1.html) 使用Multiwfn绘制NMR谱 http://sobereva.com/565(http://bbs.keinsci.com/thread-19711-1-1.html) 根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例 http://sobereva.com/165 使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据 http://sobereva.com/552(http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html) |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-2-22 09:15 , Processed in 0.170350 second(s), 25 queries , Gzip On.