求助：怎么输出电场强度

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发布时间: 2023-6-20 22:20

我在mdp文件中施加了电场，想看一下是否正确，怎么输出如下图形

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lees 发表于 Post on 2023-7-12 16:04:32

wuxiaofei 发表于 2023-7-12 15:46
我理解的是在三个方向设置不同的参数，我上边是给y轴设置了。

谢谢楼主的回答，经sob老师回答说只能通过改源程序达到目的，mdp修改没法设，现在正在研究源程序部分

wuxiaofei 发表于 Post on 2023-7-12 15:47:16

lees 发表于 2023-7-11 10:43
请教楼主是否知道如何施加非对称性余弦电场

wuxiaofei 发表于 Post on 2023-7-12 15:46:59

lees 发表于 2023-7-11 10:43
请教楼主是否知道如何施加非对称性余弦电场

我理解的是在三个方向设置不同的参数，我上边是给y轴设置了。

lees 发表于 Post on 2023-7-11 10:43:28

请教楼主是否知道如何施加非对称性余弦电场

lees 发表于 Post on 2023-7-11 10:41:56

sobereva 发表于 2023-6-21 14:02
是

请问老师，gromacs如何修改mdp来施加非对称的余弦的电场

sobereva 发表于 Post on 2023-6-21 14:02:25

wuxiaofei 发表于 2023-6-21 10:33
老师，我施加频率为1000HZ 电压为1V，模拟步长300ns是不在gromacs里边不现实，electric-field-y = 0.28 0 ...

是

wuxiaofei 发表于 Post on 2023-6-21 10:33:48

sobereva 发表于 2023-6-20 23:25
mdrun加上-field指定输出的记录电场信息的xvg文件名，之后对xvg作图

老师，我施加频率为1000HZ 电压为1V，模拟步长300ns是不在gromacs里边不现实，electric-field-y = 0.28 0.000001 0 0；我看到输出的电场强度数据都是0.28，是不因为频率太小只会走一个周期的一点点，导致像是施加了恒定电场

wuxiaofei 发表于 Post on 2023-6-21 08:48:51

sobereva 发表于 2023-6-20 23:25
mdrun加上-field指定输出的记录电场信息的xvg文件名，之后对xvg作图

好的，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2023-6-20 23:25:19

mdrun加上-field指定输出的记录电场信息的xvg文件名，之后对xvg作图

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