求助：如何对聚合物单体上的同种原子进行划分，如C1、C2、C3，并统计与其成键数。

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发布时间: 2023-6-22 10:53

在阅读一篇文献时遇到了一些问题。这项研究使用reaxff力场在lammps中对纤维素进行拉伸模拟，观察纤维素链的失效机制，对不同种类的失效的共价键数量进行了探究。我在ovito中使用create bond模块，通过设置不同共价键 ...

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耿无敌 发表于 Post on 2023-6-24 10:24:06

sobereva 发表于 2023-6-23 01:18
原理上用VMD结合自己写的tcl脚本可以实现。循环每一帧，重新判断成键关系，对每种原子名的循环与之成键的其 ...

谢谢老师的解答，我去试试。

sobereva 发表于 Post on 2023-6-23 01:18:32

原理上用VMD结合自己写的tcl脚本可以实现。循环每一帧，重新判断成键关系，对每种原子名的循环与之成键的其它原子，从而检查不同原子名组合之间的键都有多少

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耿无敌	+ 4	谢谢

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