计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 用gromacs计算聚乙烯熔点的疑问

用gromacs计算聚乙烯熔点的疑问

查看数: 1275 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

古德猫宁341

发布时间: 2023-6-24 13:06

正文摘要:

各位老师好，我想用gromacs模拟计算聚乙烯的熔点。由于熔点是一个相变点，在熔点附近体系的密度会发生明显的变化，因此我想用体系的温度和密度进行作图来计算熔点。请问这样的思路是否可行？我尝试了将聚乙烯从300 ...

回复 Reply

古德猫宁341 发表于 Post on 2023-6-24 18:49:11

slxc920113 发表于 2023-6-24 17:08
1. 初始的结构不是晶体
2. 每一步的时间还太短

感谢老师您的回答，能请您说得详细一些吗？要怎么生成初始结构比较合理？我的初始结构是用MS中的聚合物模块进行建模，然后在gromacs中跑了em，在800K的温度下跑了10ns的NVT和20ns的NPT，最后降温至300K。
关于模拟时间的问题，由于体系中原子数量比较多，步长大了之后模拟时间会很长，同时我也不清楚步长设为多大才比较合适，能请老师您给一些建议吗？谢谢

slxc920113 发表于 Post on 2023-6-24 17:08:48

1. 初始的结构不是晶体
2. 每一步的时间还太短

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register