sobereva 发表于 2023-6-26 18:39 谢谢老师整理了这么清晰又详细的链接,我去好好学习一下 |
用完全免费、极为流行的molclus比收费的GMMX强多了。本论坛基本没人用GMMX 构型和构象搜索程序Molclus主页:http://www.keinsci.com/research/molclus.html 使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具 http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html genmer:生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具 http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html 将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html 使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索 http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html 使用molclus做构型/构象搜索发表的巨量文章:http://www.keinsci.com/research/molclus.html#publist |
有个很像的且就是原来作者课题组的免费程序 PCModel 10 也可替代GMMX 这俩的算法基本一样的。支持的输入文件也是gjf sdf这种。 |
zjxitcc 发表于 2023-6-26 12:56 原来是这样,我说怎尝试都不行。谢谢老师解惑 |
这个是收费模块,要购买。有大量免费的、支持量子化学计算水平的构象搜索程序可用,例如 ABCluster《ABCluster 3.0发布!各种团簇+构象搜索+内置xTB+...》http://bbs.keinsci.com/thread-26088-1-1.html Molclus《使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索》http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html |
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