VMD选择特定区域的原子的index.ndx文件保存问题

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发布时间: 2023-7-1 17:42

大家好，我在使用VMD选择特定区域的原子时想要保存它为index.ndx文件以便在GROAMCS中进行后续分析，但是我的这个似乎没有，应该怎样解决呢？因为VMD能够比较直观的选择我想要区域的原子，gmx select 的 ...

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熊小熊 发表于 Post on 2023-7-2 22:32:33

sobereva 发表于 2023-7-2 02:01
VMD自己没有保存成GROMACS的index文件的功能。我在北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci ...

好的，谢谢老师！

sobereva 发表于 Post on 2023-7-2 02:01:14

VMD自己没有保存成GROMACS的index文件的功能。我在北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里给了个我写的VMD tcl脚本可以实现这个目的：

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