Kamistry 发表于 2024-2-7 19:11 因为ilowfreq=3是对谐振模型算的结果和自由转子算的结果进行插值得到的,ZPE校正因子会影响前者,因此会影响总结果。此时没必要设ZPE校正因子(即保持默认的1) |
sobereva 发表于 2024-1-19 01:15 卢老师,我发现在使用ilowfreq=3时,改变ZPE校正因子对结果仍有影响,那么这里第二个问题的回答是不是仍应该查对应的校正因子并设置呢? |
Kamistry 发表于 2024-1-18 09:53 TCU、TCH、TCG指代不明。其它是 不 是 |
请问老师,在使用ilowfreq=3的情况下, 1) ZPE无法单独得到,那么SI中不列出ZPE而只需要列出单点能、TCU、TCH、TCG、H、G、imainary frequency吗? 2) 还需要设置ZPE的校正吗? 3) 除了引用Shermo原文外,是否应该描述使用了"ilowfreq=3"选项,并引用J. Comput. Chem., 44, 1807–1816 (2023)呢? |
今日更新了Shermo 2.4.2,修正了实现Minenkov模型时的一个bug(free rotor贡献少了个1/2因子)。请使用Minenkov模型做计算的用户务必更新 |
dantevinsky 发表于 2023-7-9 21:34 那个做法本来idea就不好,是显而易见的artificial,不是时代因素(计算资源或热力学理论上的发展)的制约而迫不得已的必然选择。这和他的其它计算热力学方面的贡献和他搞的更严格但也明显更复杂更耗时的模型如一维受阻转子、MS-LH、MS-T等没直接关系。 要是Grimme的做法更早被提出来(或者说Grimme更早一些把研究兴趣放在自由能计算问题上),我相信Truhlar就不会再主张那种人为一刀切改频率的做法了。然而由于一刀切改频率的做法在以往的文章中大量出现,目前还有人在这么做,而且还有很多人没意识到已经有了更好的黑箱方法,所以还是需要在该提及的时候提及,直到鲜有人用为止。 |
。。。。笑死,Truhlar在自由能矫正领域做了那么多工作。这个设置上限的方法是过去or面对大量结构采样时才不得已才用的。结果被社长抓着猛批,每次shermo更新批评一次。 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2024-11-25 13:14 , Processed in 0.200389 second(s), 26 queries , Gzip On.