计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助：2023版gromacs使用4090显卡低功耗，低性能的问题

求助：2023版gromacs使用4090显卡低功耗，低性能的问题

查看数: 2360 | 评论数: 7 | 收藏 Add to favorites 1

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

Zbin

发布时间: 2023-7-11 11:13

正文摘要:

本帖最后由 Zbin 于 2023-7-11 11:12 编辑我利用4090显卡（CPU:AMD EPYC 7763）利用gromacs进行MD模拟，发现运算速度和3090一样（相同体系和参数设置），并没有很大提升。以下是MD模拟的运行命令。 gmx mdrun -v ...

回复 Reply

Entropy.S.I 发表于 Post on 2025-1-3 15:29:11

youknowdcf 发表于 2025-1-3 14:36
大佬请问一下，现在可用作生产模拟的gromac gpu加速版选哪个好些？我目前用的还是2019.3，感觉有些落后了 ...

2023.5或2024.4，取决于你是否需要2024的feature

youknowdcf 发表于 Post on 2025-1-3 14:36:45

Entropy.S.I 发表于 2023-7-11 13:35
CPU用EPYC 7763，本来就没什么救，在这种CPU下把4090当4080用即可。谁让你买单核性能一塌糊涂的7763呢，看 ...

大佬请问一下，现在可用作生产模拟的gromac gpu加速版选哪个好些？我目前用的还是2019.3，感觉有些落后了。

Zbin 发表于 Post on 2023-7-12 10:56:33

Entropy.S.I 发表于 2023-7-11 13:35
CPU用EPYC 7763，本来就没什么救，在这种CPU下把4090当4080用即可。谁让你买单核性能一塌糊涂的7763呢，看 ...

感谢，加了-bonded gpu后可以与5950/13900+4090基本打平，速度满足需求。另外，这种配置主要也平衡pytorch的多卡使用，并不完全做MD。

Entropy.S.I 发表于 Post on 2023-7-11 13:35:45

CPU用EPYC 7763，本来就没什么救，在这种CPU下把4090当4080用即可。谁让你买单核性能一塌糊涂的7763呢，看了我文章还买这种CPU，只能尊重祝福了。

先用nvidia-smi -q看看PCIe连接在什么速率，再尝试-bonded gpu。正常来说使用-bonded gpu后4090相较于3090速度至少有90%提升，当然，你这CPU也不能奢求太多，即使-bonded gpu估计也就70~80%。

牧生 发表于 Post on 2023-7-11 12:56:07

本帖最后由牧生于 2023-7-11 12:58 编辑

http://bbs.keinsci.com/thread-37587-1-1.html

从第七楼开始往下看，看你是不是一样的

Zbin 发表于 Post on 2023-7-11 11:44:20

dzdhp 发表于 2023-7-11 11:39
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=33296&highlight=4090
你看看这位老师的测试

这个帖子我们很早就关注了，但并不能解决出现的问题

dzdhp 发表于 Post on 2023-7-11 11:39:06

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... &highlight=4090
你看看这位老师的测试

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register