liuyjhx 发表于 2019-12-27 15:28 没问题的 |
sobereva 发表于 2016-8-5 22:41 老师请问结构优化和频率用高斯？单点能用ORCA可以吗？ |
长颈鹿先森 发表于 2019-4-18 17:26 分区合不合理完全看具体用户怎么用 既然home都没怎么用，你把GAUSS_SCRDIR指向home下某个目录 |
sobereva 发表于 2019-4-16 11:07 sob老师，我再次运行了一个输入文件，使用df -hl查看了硬盘空间，发现挂载点 / 的剩余空间不足，我看挂载点 /home的空间基本就没用上，使用CCSD(T)计算单点能时，我看一直占用的是挂载点的空间。我把g09解压放在了主目录里，scratch文件放在g9下面了（root用户登录的）。我当时装Linux系统分区的时候，搜了论坛，看到说给/50G ，/boot 1G, 剩下的都给/home。您看我这电脑分区合理吗，学生不太懂Linux分区的事情，如果我设置的不合理，需要重新分区的话，您的建议呢？重新分区后是不是可以避免硬盘不足的问题，还是说现在的分区合适，需要装机械硬盘来分割rwf文件呢？ |
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长颈鹿先森 发表于 2019-4-16 09:00 1 分割rwf文件，能装在固态的部分在固态，没地方的装在机械 2 不用重装。只对新装的硬盘分区即可。能 3 是。或者修改GAUSS_SCRDIR |
sobereva 发表于 2019-4-16 00:03 谢谢老师，我还有有几点不懂的地方，麻烦您解惑。 第一：把读写文件放到机械硬盘里，那我用CCSD(T)计算的时候，会大量读写文件，机械硬盘的读写速度不及固态，计算耗时是不是就增加了，那我装固态还有意义吗？ 第二：我如果装上机械硬盘，还用重装Linux系统吗，Centos还用重新分区吗，高斯计算的时候能识别出来机械硬盘吗？ 第三：您说的把读写文件存储到机械上，是指定%rwf文件的存储位置就行是吧 |
长颈鹿先森 发表于 2019-4-15 10:49 就是临时文件目录写满了 弄个几T的机械插上，作为读写文件储存的地方。要么借助MP2估算CCSD(T)/大基组能量 |
本帖最后由 长颈鹿先森 于 2019-4-15 21:24 编辑 sobereva 发表于 2016-8-5 22:41 sob老师，我在Linux系统中的高斯上计算18个原子的单点能，用的是CCSD(T)/cc-pVTZ，计算过程中中弹出硬盘不足，我随后看了rwf文件200多GB。我在500G固态硬盘里面就装了Centos系统和高斯软件，其他什么都没装。请问这种情况应该怎么解决呢？ |
升腾 发表于 2016-8-8 18:24 传教成功  |
| 换成Orca之后速度简直就是飞起，同样的基组8核运算，上述体系用了47分钟就结束了。简直太强了。 |
| 嗯嗯，好的，谢谢老师。 |
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基组如果再降的话就对不起双杂化泛函了，还不如泛函降成普通泛函。 强烈推荐用ORCA做双杂化泛函计算，支持的PWPB95比B2PLYP好很多，而且开了RI后速度比Gaussian快N倍甚至一个数量级，而且资源消耗也小得多。算五六十个原子用双杂化泛函哪怕结合def2-QZVP，在四核机子上也就几个小时就算完了。ORCA是算双杂化的神器。这里有说明 大体系弱相互作用计算的解决之道 http://sobereva.com/214 |
| 参与人数Participants 1 | eV +3 | 收起 理由Reason |
|---|---|---|
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| + 3 | 我很赞同 |
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本帖最后由 冰释之川 于 2016-8-5 22:33 编辑 干什么要用B2PLYP 双杂化泛函呢？相当于做了MP2。。。这么大体系的MP2配上大基组当然奔不动。。换def2-SVP试试看，不行再减小基组或者换方法 |
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